Biologen og den tidligere soldat Lena (Natalie Portman) rystes, da hendes mand (Oscar Isaac) kommer hjem og er døden nær efter en hemmelig mission i The Shimmer en mystisk karantænezone, ingen nogensinde er vendt tilbage fra. Nu må Lena og hendes eliteteam betræde en smuk, dødsensfarlig verden af muterede landskaber og væsener for at stoppe det voksende fænomen, der truer alt liv på Jorden