I den nære fremtid er der en energikrise på Jorden. Cloverfield Stationen som er bemandet af et multinational mandskab, skal teste Shepard Partikel Acceleratoren som er designet til at levere energi til alle landene i verden, så energiproblemet kan løses. Eksperimentet går dog galt, og jorden forsvinder. Hvad er der sket og er denne situation permanent?